Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms