Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrna9G3X8Z7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrna9G3X8Z7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrna9G3X8Z7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrna9G3X8Z7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrna9G3X8Z7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrna9G3X8Z7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrna9G3X8Z7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms