Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx1-1G3UXB3 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms