Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms