Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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