Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ercc6F8VPZ5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ercc6F8VPZ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms