Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp9yF8VPU6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms