Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28048F7BCN0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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