Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crocc2F6XLV1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Crocc2F6XLV1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crocc2F6XLV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms