Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm28374F6SG70 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28374F6SG70 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28374F6SG70 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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