Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29094F6Q785 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29094F6Q785 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms