Protein–RNA interactions for Protein: E9QAW0

Zfp213, Zinc finger protein 213, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp213E9QAW0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zfp213E9QAW0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms