Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp31E9Q6Y8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms