Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn2r116E9Q6I0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms