Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ApobE9Q414 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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