Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms