Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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