Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ccdc171E9Q1U1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ccdc171E9Q1U1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc171E9Q1U1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ccdc171E9Q1U1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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