Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms