Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myo5cE9Q1F5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5cE9Q1F5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms