Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc1E9Q043 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc1E9Q043 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms