Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddx60E9PZQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddx60E9PZQ1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms