Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms