Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgaE9PV24 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms