Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms