Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms