Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms