Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc8D3YZV8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms