Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif28pD3YXS5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms