Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc170D3YXL0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms