Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim30cD3YVI9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms