Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc13D3YV10 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc13D3YV10 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms