Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptprz1B9EKR1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms