Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Cttnbp2B9EJA2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cttnbp2B9EJA2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cttnbp2B9EJA2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms