Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apol6B7ZC55 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol6B7ZC55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms