Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf11cB4XVP9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms