Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cspp1B2RX88 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms