Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clrn2B2RVW2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clrn2B2RVW2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms