Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms