Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms