Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rrn3B2RS91 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrn3B2RS91 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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