Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Brpf1B2RRD7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms