Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb8B1AY40 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb8B1AY40 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms