Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms