Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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