Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms