Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5640A3KG49 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5640A3KG49 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms