Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b5A3FIN4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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