Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Palm3A2TJV2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms