Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms